無尾港水鳥保護區位於宜蘭縣蘇澳鎮內，核心區河道為南北流向，區內涵蓋河流、湖泊、沼澤、旱田、沙灘、防風林及山丘樹林等生態環境。
就地理位置而言，保護區以蘇澳鎮港邊里海岸防風林內湖泊沼澤為中心，東臨太平洋、西界岳明國小，南至澳仔角崖邊、北抵新城溪。
無尾港地區的主要河川均源自新城溪，1968年因娜定颱風山洪爆發，土石淹沒農田，河流改道，河口淤積，形成沒口河而被稱為『無尾港』，是一處感潮型沼澤濕地。